Microsoft MPI 하에서 pbdMPI 설치, 실행

참고 URL:

https://github.com/RBigData/pbdMPI/blob/master/INSTALL

1. 위 링크와 같이 MS MPI, R, Rtools 를설치한다. 

2. 다음과 같이 환경변수를 설정해준다.

SET R_HOME=C:\Program Files\R\R-3.0.1\

SET RTOOLS=C:\Rtools\bin\

SET MINGW=C:\Rtools\gcc-4.6.3\bin\

SET MPI_ROOT=C:\Program Files\Microsoft MPI\

SET PATH=%R_HOME%;%R_HOME%BIN\;%RTOOLS%;%MINGW%;%MPI_ROOT%BIN\;%PATH_ORG%

3. 다음에서 pbdMPI의 zip 파일을 받는다.

https://cran.r-project.org/web/packages/pbdMPI/index.html

4. 아래 명령으로 명령창에서 받은 파일을 설치한다.

R CMD INSTALL pbdMPI_0.3-2.zip

5. 아래 명령으로 명령창에 실행해 제대로 되는지 본다.

mpiexec -np 2 Rscript.exe -e "library(pbdMPI);init();finalize()"